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1986年，招收管理信息系统专业本科班；数学教研室并入。

1991年，专业更名为经济信息管理专业；计算中心并入。

1993年，因成立基础部需要，数学教研室分出。

2000年，获得管理科学与工程一级学科硕士学位授予权。

2002年，增设电子商务本科专业，管理科学与工程被列为省重点扶持学科。

2003年，信息管理与信息系统专业被列为省重点建设专业；在工商管理博士点设立企业管理信息化与决策支持系统研究方向。

2004年，增设物流管理本科专业；管理科学与工程被列为省A类重点学科。

2009年，增设物流工程领域工程硕士点；电子商务专业被列为省重点建设专业。

2010年，获批“电子商务与物流优化浙江省高等学校创新团队”。

2011年，获批“电子商务技术浙江省重点创新团队”；浙江省电子商务与物流信息技术研究重点实验室。

2012年，与政府、企业联合成立“杭州电子商务研究院”；电子商务同时被列为浙江省优势专业。

2013年，琚春华教授和傅培华教授分别获聘为电子商务类专业和物流管理与工程类专业教育部高等学校教学指导委员会委员

2014年，获批“电子商务与商务大数据技术省工程实验室”，“电子商务与现代物流浙江国际科技合作基地”，“现代商贸信息技术与工程省重点实验教学中心”。

2015年，“管理科学与工程”获得省A类一流学科；国家级平台“电子商务虚拟仿真中心”被教育部获批为国家级虚拟仿真实验教学中心；

2016年，“面向智慧商务的“工管融合、分层组合、多元结合”三创人才培养模式》获浙江省教学成果奖一等奖；电子商务专业入选浙江省高校“十三五”优势专业建设项目

2017年，王海燕院长主持的“大数据驱动的全景式食品质量安全云决策公共服务平台及示范研究”获2017年国家自然科学基金“大数据驱动的管理与决策研究”重大研究计划重点项目资助;物流管理专业入选浙江省高校“十三五”特色专业建设项目；封毅老师获浙江省第十届青年教师教学竞赛获工科组特等奖（全省第一名），项益鸣老师获浙江省首届创新创业课程微课教学比赛第一名；项益鸣老师获浙江工商大学首届教学卓越奖特等奖。

2018年，“基于分层组合、工管融合、多元结合的三创型智慧商务人才培养探索与实践”获得2018年高等教育国家级教学成果二等奖。承办国家自然科学基金委员会管理学部委托的“第十七届中韩质量双边论坛”。琚春华教授当选教育部电子商务专业教育指导委员会委员，傅培华教授当选教育部物流管理与工程类专业教学指导委员会委员。

2019年，杭州钱塘新区管委会与浙江工商大学正式签订战略合作框架协议，双方共建中国（杭州）跨境电商学院;物流管理专业、电子商务专业入选首批国家一流专业建设点;信管商贸教师党支部成功入选浙江省和教育部党建工作样板支部培育创建对象。

2020年，信管-商贸教师党支部完成全国党建工作样板支部创建工作；信息管理与信息系统专业入选浙江省一流专业建设点。

2021年，成立浙江工商大学（富阳）食药质量安全工程研究院；跨境电商学院入选国家发改委教育强国“十四五”推进工程项目。

2022年，信管商贸教师党建工作样板支部验收通过；跨境电商学院入选首批省级重点现代产业学院；“RCEP框架下跨境电商推进数字贸易强国建设的机制和路径研究”获国家社科基金重点项目。

2023年，跨境电商学院受中央电视台《经济半小时》节目报道；李进教授在国际商科顶级期刊Production and Operations Management发表论文；论文《Supplier emcroachment strategy in the presence of retail strategic inventory: Centralization or decentralization?》获浙江省第二十二届哲学社会科学优秀成果一等奖；著作《移动商务精准服务推荐方法与应用：基于用户隐私关注视角》获浙江省第二十二届哲学社会科学优秀成果一等奖。